太阳系诞生于46亿年前的一片巨大分子云中的一小块引力塌陷。这一小块引力中大多塌缩质量集中在中心区域形成太阳，其他的部分分摊屏并形成了原行星盘，经过数年的演变，形成了卫星、行星和其他小型的太阳系天体系统。太阳系自形成开始经历了相当大的变化，其中的卫星由环绕母星气体与尘埃组成的星盘中形成，其他卫星或者是遇到了巨大的碰撞，比如地球的卫星月球就是经过巨大碰撞出现的。
天体间的碰撞持续性发生，是太阳系演化的中心，其他形成的位置经过迁移会彼此异位，就像太阳与行星的出生一样，迟早会走向灭亡，太阳在大约50亿年之后会冷却并向外膨胀，抛去外层成为行云状星云，留下被称之为白海星的恒星尸骸，太阳的环绕行星也许在遥远的未来会逐渐被经过的恒星引力吸走，其中一部分会被毁掉，另一部分会抛向星际太空。太阳在经过数万亿年之后会独自处在太阳系中，在太阳系上不会有其他天梯。
第1次记载“太阳系”术语的使用是1704年，现今太阳系形成的标准理论是星云假说，这个标准理论是在18世纪被伊曼纽·斯威登堡、皮埃尔-西蒙·拉普拉斯、伊曼努尔·康德提出之日起经过采纳摒弃，星云假说被弃用是因为该假说没办法解释太阳相对其行星而言缺少了角动量。
1980年代早期的研究人员对新恒星的研究发现恒星就如同星云假想预测一般，是被冷的气体与灰尘缠绕。这一假想再次被接受。也许在几十亿年或者几百亿年之后太阳会完全停止闪耀，成为一座黑矮星。